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DDN通過自動化,人工智能和機器學習功能來發(fā)現(xiàn)新藥

倩倩 ? 來源:百度粉絲網(wǎng) ? 2020-09-10 15:54 ? 次閱讀

DDN 宣布,其高性能 存儲解決方案 已幫助支持Recursion的更廣泛,更快和更高效的藥物發(fā)現(xiàn)研究和運營 ,該數(shù)字生物學公司通過自動化,人工智能機器學習(ML)功能來發(fā)現(xiàn)新藥。閱讀“ 遞歸”案例研究 ,該 案例描述了基礎(chǔ)架構(gòu)的挑戰(zhàn),解決方案和優(yōu)勢,并揭示了鹽湖城正在進行的具有全球影響力的工作的細節(jié)。

在大多數(shù)行業(yè)都在為不斷增加的藥物發(fā)現(xiàn)成本和上市時間挑戰(zhàn)而戰(zhàn)的情況下,遞歸采用了結(jié)合了科學技術(shù)方法的新方法。這就需要針對AI和ML進行全面優(yōu)化的高性能藥物發(fā)現(xiàn)處理,旨在從世界上最大的生物圖像庫中釋放最大的數(shù)據(jù)價值。

“我們的數(shù)據(jù)是我們的公司,因此我們需要強大的存儲架構(gòu)來支持AI驅(qū)動的模型,” Recursion的首席系統(tǒng)工程師Kris Howard說?!肮芾砦覀兊拇笠?guī)模數(shù)據(jù)需求需要快速提取,優(yōu)化處理并減少應(yīng)用程序運行時間。”

與DDN的領(lǐng)域?qū)<液献?,Recursion最初創(chuàng)建了一個概念證明,其中包含DDN的 EXAScaler ES400NV和ES7990X并行文件系統(tǒng)設(shè)備,這些設(shè)備后來被擴展為2PBs的容量,用于登臺ML模型。全閃存層被用作充足的旋轉(zhuǎn)磁盤支持的文件系統(tǒng)的前端,每個文件的前64K存根到該層,然后加速訪問數(shù)據(jù)的第一部分,然后將其余部分流式傳輸?shù)叫D(zhuǎn)盤。

使用DDN,Recursion每周執(zhí)行約350,000個實驗,并針對數(shù)百種疾病模型篩選數(shù)千種化合物,而現(xiàn)在的成本和時間僅是傳統(tǒng)藥物發(fā)現(xiàn)方法的一小部分。DDN的混合高性能可擴展存儲解決方案針對AI和ML進行了全面優(yōu)化,有助于降低成本并提高生物學研究的效率。

DDN總裁兼聯(lián)合創(chuàng)始人Paul Bloch說:“ DDN作為存儲領(lǐng)導者的聲譽因我們成熟的解決方案和對AI數(shù)據(jù)存儲的日益關(guān)注而得到鞏固。” DDN利用智能基礎(chǔ)架構(gòu)來提供最全面的以數(shù)據(jù)為中心的以AI為中心的解決方案集,DDN靈活調(diào)整Recursion的配置以滿足特定工作負載的靈活性,帶來了強大的存儲,可無縫支持18個節(jié)點和136個GPU。作為遞歸的存儲基礎(chǔ)架構(gòu)提供者而受到信任是一項真正的榮譽,因為他們致力于破壞傳統(tǒng)的藥物發(fā)現(xiàn)方法并準確高效地確定疾病的治療方法?!?/p>

盡管傳統(tǒng)的存儲架構(gòu)無法滿足Recursion嚴格的高性能文件處理要求,但DDN的2PB高性能多層數(shù)據(jù)管理基礎(chǔ)架構(gòu)已幫助最大化GPU計算資源用于加速的AI工作流程。這種方法不僅為Recursion的苛刻工作負載提供了極快的性能,而且還有助于緩解文件訪問瓶頸,同時實現(xiàn)了對GPU的高效流傳輸。

“我們的DDN存儲非常快,”霍華德說。“ Flash層使文件訪問時間減少了40%,我們可以將GPU的利用率提高到100%,并固定在那里。從PFS訓練數(shù)據(jù)是非常不尋常的,但這對于我們的用例來說是一個完美的解決方案?!?/p>

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