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如何在python中安裝和使用頂級(jí)聚類算法?

深度學(xué)習(xí)自然語言處理 ? 來源:海豚數(shù)據(jù)科學(xué)實(shí)驗(yàn)室 ? 作者:海豚數(shù)據(jù)科學(xué)實(shí)驗(yàn) ? 2021-03-12 18:23 ? 次閱讀

聚類或聚類分析是無監(jiān)督學(xué)習(xí)問題。它通常被用作數(shù)據(jù)分析技術(shù),用于發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)中的有趣模式,例如基于其行為的客戶群。有許多聚類算法可供選擇,對(duì)于所有情況,沒有單一的最佳聚類算法。相反,最好探索一系列聚類算法以及每種算法的不同配置。在本教程中,你將發(fā)現(xiàn)如何在 python 中安裝和使用頂級(jí)聚類算法。

完成本教程后,你將知道:

聚類是在輸入數(shù)據(jù)的特征空間中查找自然組的無監(jiān)督問題。

對(duì)于所有數(shù)據(jù)集,有許多不同的聚類算法和單一的最佳方法。

在 scikit-learn 機(jī)器學(xué)習(xí)庫的 Python 中如何實(shí)現(xiàn)、適配和使用頂級(jí)聚類算法。讓我們開始吧。

教程概述

本教程分為三部分:

聚類

聚類算法

聚類算法示例庫安裝

聚類數(shù)據(jù)集

親和力傳播

聚合聚類

BIRCH

DBSCAN

K-均值

Mini-Batch K-均值

Mean Shift

OPTICS

光譜聚類

高斯混合模型

一。聚類

聚類分析,即聚類,是一項(xiàng)無監(jiān)督的機(jī)器學(xué)習(xí)任務(wù)。它包括自動(dòng)發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)中的自然分組。與監(jiān)督學(xué)習(xí)(類似預(yù)測(cè)建模)不同,聚類算法只解釋輸入數(shù)據(jù),并在特征空間中找到自然組或群集。

聚類技術(shù)適用于沒有要預(yù)測(cè)的類,而是將實(shí)例劃分為自然組的情況。

—源自:《數(shù)據(jù)挖掘頁:實(shí)用機(jī)器學(xué)習(xí)工具和技術(shù)》2016年。

群集通常是特征空間中的密度區(qū)域,其中來自域的示例(觀測(cè)或數(shù)據(jù)行)比其他群集更接近群集。群集可以具有作為樣本或點(diǎn)特征空間的中心(質(zhì)心),并且可以具有邊界或范圍。

這些群集可能反映出在從中繪制實(shí)例的域中工作的某種機(jī)制,這種機(jī)制使某些實(shí)例彼此具有比它們與其余實(shí)例更強(qiáng)的相似性。

—源自:《數(shù)據(jù)挖掘頁:實(shí)用機(jī)器學(xué)習(xí)工具和技術(shù)》2016年。

聚類可以作為數(shù)據(jù)分析活動(dòng)提供幫助,以便了解更多關(guān)于問題域的信息,即所謂的模式發(fā)現(xiàn)或知識(shí)發(fā)現(xiàn)。例如:該進(jìn)化樹可以被認(rèn)為是人工聚類分析的結(jié)果;

將正常數(shù)據(jù)與異常值或異常分開可能會(huì)被認(rèn)為是聚類問題;

根據(jù)自然行為將集群分開是一個(gè)集群?jiǎn)栴},稱為市場(chǎng)細(xì)分。

聚類還可用作特征工程的類型,其中現(xiàn)有的和新的示例可被映射并標(biāo)記為屬于數(shù)據(jù)中所標(biāo)識(shí)的群集之一。雖然確實(shí)存在許多特定于群集的定量措施,但是對(duì)所識(shí)別的群集的評(píng)估是主觀的,并且可能需要領(lǐng)域?qū)<摇Mǔ?,聚類算法在人工合成?shù)據(jù)集上與預(yù)先定義的群集進(jìn)行學(xué)術(shù)比較,預(yù)計(jì)算法會(huì)發(fā)現(xiàn)這些群集。

聚類是一種無監(jiān)督學(xué)習(xí)技術(shù),因此很難評(píng)估任何給定方法的輸出質(zhì)量。

—源自:《機(jī)器學(xué)習(xí)頁:概率觀點(diǎn)》2012。

二。聚類算法

有許多類型的聚類算法。許多算法在特征空間中的示例之間使用相似度或距離度量,以發(fā)現(xiàn)密集的觀測(cè)區(qū)域。因此,在使用聚類算法之前,擴(kuò)展數(shù)據(jù)通常是良好的實(shí)踐。

聚類分析的所有目標(biāo)的核心是被群集的各個(gè)對(duì)象之間的相似程度(或不同程度)的概念。聚類方法嘗試根據(jù)提供給對(duì)象的相似性定義對(duì)對(duì)象進(jìn)行分組。

—源自:《統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)的要素:數(shù)據(jù)挖掘、推理和預(yù)測(cè)》,2016年

一些聚類算法要求您指定或猜測(cè)數(shù)據(jù)中要發(fā)現(xiàn)的群集的數(shù)量,而另一些算法要求指定觀測(cè)之間的最小距離,其中示例可以被視為“關(guān)閉”或“連接”。因此,聚類分析是一個(gè)迭代過程,在該過程中,對(duì)所識(shí)別的群集的主觀評(píng)估被反饋回算法配置的改變中,直到達(dá)到期望的或適當(dāng)?shù)慕Y(jié)果。scikit-learn 庫提供了一套不同的聚類算法供選擇。下面列出了10種比較流行的算法:親和力傳播

聚合聚類

BIRCH

DBSCAN

K-均值

Mini-Batch K-均值

Mean Shift

OPTICS

光譜聚類

高斯混合

每個(gè)算法都提供了一種不同的方法來應(yīng)對(duì)數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)自然組的挑戰(zhàn)。沒有最好的聚類算法,也沒有簡(jiǎn)單的方法來找到最好的算法為您的數(shù)據(jù)沒有使用控制實(shí)驗(yàn)。在本教程中,我們將回顧如何使用來自 scikit-learn 庫的這10個(gè)流行的聚類算法中的每一個(gè)。這些示例將為您復(fù)制粘貼示例并在自己的數(shù)據(jù)上測(cè)試方法提供基礎(chǔ)。我們不會(huì)深入研究算法如何工作的理論,也不會(huì)直接比較它們。讓我們深入研究一下。

三。聚類算法示例

在本節(jié)中,我們將回顧如何在 scikit-learn 中使用10個(gè)流行的聚類算法。這包括一個(gè)擬合模型的例子和可視化結(jié)果的例子。這些示例用于將粘貼復(fù)制到您自己的項(xiàng)目中,并將方法應(yīng)用于您自己的數(shù)據(jù)。1.庫安裝首先,讓我們安裝庫。不要跳過此步驟,因?yàn)槟阈枰_保安裝了最新版本。你可以使用 pip Python 安裝程序安裝 scikit-learn 存儲(chǔ)庫,如下所示:

sudo pip install scikit-learn接下來,讓我們確認(rèn)已經(jīng)安裝了庫,并且您正在使用一個(gè)現(xiàn)代版本。運(yùn)行以下腳本以輸出庫版本號(hào)。

# 檢查 scikit-learn 版本 import sklearn print(sklearn.__version__)運(yùn)行該示例時(shí),您應(yīng)該看到以下版本號(hào)或更高版本。

0.22.12.聚類數(shù)據(jù)集我們將使用 make _ classification ()函數(shù)創(chuàng)建一個(gè)測(cè)試二分類數(shù)據(jù)集。數(shù)據(jù)集將有1000個(gè)示例,每個(gè)類有兩個(gè)輸入要素和一個(gè)群集。這些群集在兩個(gè)維度上是可見的,因此我們可以用散點(diǎn)圖繪制數(shù)據(jù),并通過指定的群集對(duì)圖中的點(diǎn)進(jìn)行顏色繪制。這將有助于了解,至少在測(cè)試問題上,群集的識(shí)別能力如何。該測(cè)試問題中的群集基于多變量高斯,并非所有聚類算法都能有效地識(shí)別這些類型的群集。因此,本教程中的結(jié)果不應(yīng)用作比較一般方法的基礎(chǔ)。下面列出了創(chuàng)建和匯總合成聚類數(shù)據(jù)集的示例。

# 綜合分類數(shù)據(jù)集 from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, y = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 為每個(gè)類的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for class_value in range(2): # 獲取此類的示例的行索引 row_ix = where(y == class_value) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例將創(chuàng)建合成的聚類數(shù)據(jù)集,然后創(chuàng)建輸入數(shù)據(jù)的散點(diǎn)圖,其中點(diǎn)由類標(biāo)簽(理想化的群集)著色。我們可以清楚地看到兩個(gè)不同的數(shù)據(jù)組在兩個(gè)維度,并希望一個(gè)自動(dòng)的聚類算法可以檢測(cè)這些分組。

已知聚類著色點(diǎn)的合成聚類數(shù)據(jù)集的散點(diǎn)圖接下來,我們可以開始查看應(yīng)用于此數(shù)據(jù)集的聚類算法的示例。我已經(jīng)做了一些最小的嘗試來調(diào)整每個(gè)方法到數(shù)據(jù)集。3.親和力傳播親和力傳播包括找到一組最能概括數(shù)據(jù)的范例。

我們?cè)O(shè)計(jì)了一種名為“親和傳播”的方法,它作為兩對(duì)數(shù)據(jù)點(diǎn)之間相似度的輸入度量。在數(shù)據(jù)點(diǎn)之間交換實(shí)值消息,直到一組高質(zhì)量的范例和相應(yīng)的群集逐漸出現(xiàn) —源自:《通過在數(shù)據(jù)點(diǎn)之間傳遞消息》2007。

它是通過 AffinityPropagation 類實(shí)現(xiàn)的,要調(diào)整的主要配置是將“ 阻尼 ”設(shè)置為0.5到1,甚至可能是“首選項(xiàng)”。下面列出了完整的示例。

# 親和力傳播聚類 from numpy import unique from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from sklearn.cluster import AffinityPropagation from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, _ = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 定義模型 model = AffinityPropagation(damping=0.9) # 匹配模型 model.fit(X) # 為每個(gè)示例分配一個(gè)集群 yhat = model.predict(X) # 檢索唯一群集 clusters = unique(yhat) # 為每個(gè)群集的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for cluster in clusters: # 獲取此群集的示例的行索引 row_ix = where(yhat == cluster) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例符合訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上的模型,并預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中每個(gè)示例的群集。然后創(chuàng)建一個(gè)散點(diǎn)圖,并由其指定的群集著色。在這種情況下,我無法取得良好的結(jié)果。

數(shù)據(jù)集的散點(diǎn)圖,具有使用親和力傳播識(shí)別的聚類4.聚合聚類聚合聚類涉及合并示例,直到達(dá)到所需的群集數(shù)量為止。它是層次聚類方法的更廣泛類的一部分,通過 AgglomerationClustering 類實(shí)現(xiàn)的,主要配置是“ n _ clusters ”集,這是對(duì)數(shù)據(jù)中的群集數(shù)量的估計(jì),例如2。下面列出了完整的示例。

# 聚合聚類 from numpy import unique from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, _ = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 定義模型 model = AgglomerativeClustering(n_clusters=2) # 模型擬合與聚類預(yù)測(cè) yhat = model.fit_predict(X) # 檢索唯一群集 clusters = unique(yhat) # 為每個(gè)群集的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for cluster in clusters: # 獲取此群集的示例的行索引 row_ix = where(yhat == cluster) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例符合訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上的模型,并預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中每個(gè)示例的群集。然后創(chuàng)建一個(gè)散點(diǎn)圖,并由其指定的群集著色。在這種情況下,可以找到一個(gè)合理的分組。

使用聚集聚類識(shí)別出具有聚類的數(shù)據(jù)集的散點(diǎn)圖5.BIRCHBIRCH 聚類( BIRCH 是平衡迭代減少的縮寫,聚類使用層次結(jié)構(gòu))包括構(gòu)造一個(gè)樹狀結(jié)構(gòu),從中提取聚類質(zhì)心。

BIRCH 遞增地和動(dòng)態(tài)地群集傳入的多維度量數(shù)據(jù)點(diǎn),以嘗試?yán)每捎觅Y源(即可用內(nèi)存和時(shí)間約束)產(chǎn)生最佳質(zhì)量的聚類。 —源自:《 BIRCH :1996年大型數(shù)據(jù)庫的高效數(shù)據(jù)聚類方法》

它是通過 Birch 類實(shí)現(xiàn)的,主要配置是“ threshold ”和“ n _ clusters ”超參數(shù),后者提供了群集數(shù)量的估計(jì)。下面列出了完整的示例。

# birch聚類 from numpy import unique from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from sklearn.cluster import Birch from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, _ = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 定義模型 model = Birch(threshold=0.01, n_clusters=2) # 適配模型 model.fit(X) # 為每個(gè)示例分配一個(gè)集群 yhat = model.predict(X) # 檢索唯一群集 clusters = unique(yhat) # 為每個(gè)群集的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for cluster in clusters: # 獲取此群集的示例的行索引 row_ix = where(yhat == cluster) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例符合訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上的模型,并預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中每個(gè)示例的群集。然后創(chuàng)建一個(gè)散點(diǎn)圖,并由其指定的群集著色。在這種情況下,可以找到一個(gè)很好的分組。

使用BIRCH聚類確定具有聚類的數(shù)據(jù)集的散點(diǎn)圖6.DBSCANDBSCAN 聚類(其中 DBSCAN 是基于密度的空間聚類的噪聲應(yīng)用程序)涉及在域中尋找高密度區(qū)域,并將其周圍的特征空間區(qū)域擴(kuò)展為群集。

…我們提出了新的聚類算法 DBSCAN 依賴于基于密度的概念的集群設(shè)計(jì),以發(fā)現(xiàn)任意形狀的集群。DBSCAN 只需要一個(gè)輸入參數(shù),并支持用戶為其確定適當(dāng)?shù)闹?-源自:《基于密度的噪聲大空間數(shù)據(jù)庫聚類發(fā)現(xiàn)算法》,1996

它是通過 DBSCAN 類實(shí)現(xiàn)的,主要配置是“ eps ”和“ min _ samples ”超參數(shù)。下面列出了完整的示例。

# dbscan 聚類 from numpy import unique from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from sklearn.cluster import DBSCAN from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, _ = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 定義模型 model = DBSCAN(eps=0.30, min_samples=9) # 模型擬合與聚類預(yù)測(cè) yhat = model.fit_predict(X) # 檢索唯一群集 clusters = unique(yhat) # 為每個(gè)群集的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for cluster in clusters: # 獲取此群集的示例的行索引 row_ix = where(yhat == cluster) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例符合訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上的模型,并預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中每個(gè)示例的群集。然后創(chuàng)建一個(gè)散點(diǎn)圖,并由其指定的群集著色。在這種情況下,盡管需要更多的調(diào)整,但是找到了合理的分組。

使用DBSCAN集群識(shí)別出具有集群的數(shù)據(jù)集的散點(diǎn)圖7.K均值K-均值聚類可以是最常見的聚類算法,并涉及向群集分配示例,以盡量減少每個(gè)群集內(nèi)的方差。

本文的主要目的是描述一種基于樣本將 N 維種群劃分為 k 個(gè)集合的過程。這個(gè)叫做“ K-均值”的過程似乎給出了在類內(nèi)方差意義上相當(dāng)有效的分區(qū)。 -源自:《關(guān)于多元觀測(cè)的分類和分析的一些方法》1967年。

它是通過 K-均值類實(shí)現(xiàn)的,要優(yōu)化的主要配置是“ n _ clusters ”超參數(shù)設(shè)置為數(shù)據(jù)中估計(jì)的群集數(shù)量。下面列出了完整的示例。

# k-means 聚類 from numpy import unique from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from sklearn.cluster import KMeans from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, _ = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 定義模型 model = KMeans(n_clusters=2) # 模型擬合 model.fit(X) # 為每個(gè)示例分配一個(gè)集群 yhat = model.predict(X) # 檢索唯一群集 clusters = unique(yhat) # 為每個(gè)群集的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for cluster in clusters: # 獲取此群集的示例的行索引 row_ix = where(yhat == cluster) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例符合訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上的模型,并預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中每個(gè)示例的群集。然后創(chuàng)建一個(gè)散點(diǎn)圖,并由其指定的群集著色。在這種情況下,可以找到一個(gè)合理的分組,盡管每個(gè)維度中的不等等方差使得該方法不太適合該數(shù)據(jù)集。

使用K均值聚類識(shí)別出具有聚類的數(shù)據(jù)集的散點(diǎn)圖8.Mini-Batch K-均值Mini-Batch K-均值是 K-均值的修改版本,它使用小批量的樣本而不是整個(gè)數(shù)據(jù)集對(duì)群集質(zhì)心進(jìn)行更新,這可以使大數(shù)據(jù)集的更新速度更快,并且可能對(duì)統(tǒng)計(jì)噪聲更健壯。

。..我們建議使用 k-均值聚類的迷你批量?jī)?yōu)化。與經(jīng)典批處理算法相比,這降低了計(jì)算成本的數(shù)量級(jí),同時(shí)提供了比在線隨機(jī)梯度下降更好的解決方案。 —源自:《Web-Scale K-均值聚類》2010

它是通過 MiniBatchKMeans 類實(shí)現(xiàn)的,要優(yōu)化的主配置是“ n _ clusters ”超參數(shù),設(shè)置為數(shù)據(jù)中估計(jì)的群集數(shù)量。下面列出了完整的示例。

# mini-batch k均值聚類 from numpy import unique from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from sklearn.cluster import MiniBatchKMeans from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, _ = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 定義模型 model = MiniBatchKMeans(n_clusters=2) # 模型擬合 model.fit(X) # 為每個(gè)示例分配一個(gè)集群 yhat = model.predict(X) # 檢索唯一群集 clusters = unique(yhat) # 為每個(gè)群集的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for cluster in clusters: # 獲取此群集的示例的行索引 row_ix = where(yhat == cluster) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例符合訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上的模型,并預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中每個(gè)示例的群集。然后創(chuàng)建一個(gè)散點(diǎn)圖,并由其指定的群集著色。在這種情況下,會(huì)找到與標(biāo)準(zhǔn) K-均值算法相當(dāng)?shù)慕Y(jié)果。

帶有最小批次K均值聚類的聚類數(shù)據(jù)集的散點(diǎn)圖9.均值漂移聚類均值漂移聚類涉及到根據(jù)特征空間中的實(shí)例密度來尋找和調(diào)整質(zhì)心。

對(duì)離散數(shù)據(jù)證明了遞推平均移位程序收斂到最接近駐點(diǎn)的基礎(chǔ)密度函數(shù),從而證明了它在檢測(cè)密度模式中的應(yīng)用。 —源自:《Mean Shift :面向特征空間分析的穩(wěn)健方法》,2002

它是通過 MeanShift 類實(shí)現(xiàn)的,主要配置是“帶寬”超參數(shù)。下面列出了完整的示例。

# 均值漂移聚類 from numpy import unique from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from sklearn.cluster import MeanShift from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, _ = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 定義模型 model = MeanShift() # 模型擬合與聚類預(yù)測(cè) yhat = model.fit_predict(X) # 檢索唯一群集 clusters = unique(yhat) # 為每個(gè)群集的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for cluster in clusters: # 獲取此群集的示例的行索引 row_ix = where(yhat == cluster) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例符合訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上的模型,并預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中每個(gè)示例的群集。然后創(chuàng)建一個(gè)散點(diǎn)圖,并由其指定的群集著色。在這種情況下,可以在數(shù)據(jù)中找到一組合理的群集。

具有均值漂移聚類的聚類數(shù)據(jù)集散點(diǎn)圖10.OPTICSOPTICS 聚類( OPTICS 短于訂購點(diǎn)數(shù)以標(biāo)識(shí)聚類結(jié)構(gòu))是上述 DBSCAN 的修改版本。

我們?yōu)榫垲惙治鲆肓艘环N新的算法,它不會(huì)顯式地生成一個(gè)數(shù)據(jù)集的聚類;而是創(chuàng)建表示其基于密度的聚類結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫的增強(qiáng)排序。此群集排序包含相當(dāng)于密度聚類的信息,該信息對(duì)應(yīng)于范圍廣泛的參數(shù)設(shè)置。 —源自:《OPTICS :排序點(diǎn)以標(biāo)識(shí)聚類結(jié)構(gòu)》,1999

它是通過 OPTICS 類實(shí)現(xiàn)的,主要配置是“ eps ”和“ min _ samples ”超參數(shù)。下面列出了完整的示例。

# optics聚類 from numpy import unique from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from sklearn.cluster import OPTICS from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, _ = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 定義模型 model = OPTICS(eps=0.8, min_samples=10) # 模型擬合與聚類預(yù)測(cè) yhat = model.fit_predict(X) # 檢索唯一群集 clusters = unique(yhat) # 為每個(gè)群集的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for cluster in clusters: # 獲取此群集的示例的行索引 row_ix = where(yhat == cluster) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例符合訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上的模型,并預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中每個(gè)示例的群集。然后創(chuàng)建一個(gè)散點(diǎn)圖,并由其指定的群集著色。在這種情況下,我無法在此數(shù)據(jù)集上獲得合理的結(jié)果。

使用OPTICS聚類確定具有聚類的數(shù)據(jù)集的散點(diǎn)圖11.光譜聚類光譜聚類是一類通用的聚類方法,取自線性線性代數(shù)。

最近在許多領(lǐng)域出現(xiàn)的一個(gè)有希望的替代方案是使用聚類的光譜方法。這里,使用從點(diǎn)之間的距離導(dǎo)出的矩陣的頂部特征向量。 —源自:《關(guān)于光譜聚類:分析和算法》,2002年

它是通過 Spectral 聚類類實(shí)現(xiàn)的,而主要的 Spectral 聚類是一個(gè)由聚類方法組成的通用類,取自線性線性代數(shù)。要優(yōu)化的是“ n _ clusters ”超參數(shù),用于指定數(shù)據(jù)中的估計(jì)群集數(shù)量。下面列出了完整的示例。

# spectral clustering from numpy import unique from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from sklearn.cluster import SpectralClustering from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, _ = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 定義模型 model = SpectralClustering(n_clusters=2) # 模型擬合與聚類預(yù)測(cè) yhat = model.fit_predict(X) # 檢索唯一群集 clusters = unique(yhat) # 為每個(gè)群集的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for cluster in clusters: # 獲取此群集的示例的行索引 row_ix = where(yhat == cluster) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例符合訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上的模型,并預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中每個(gè)示例的群集。然后創(chuàng)建一個(gè)散點(diǎn)圖,并由其指定的群集著色。在這種情況下,找到了合理的集群。

使用光譜聚類聚類識(shí)別出具有聚類的數(shù)據(jù)集的散點(diǎn)圖12.高斯混合模型高斯混合模型總結(jié)了一個(gè)多變量概率密度函數(shù),顧名思義就是混合了高斯概率分布。它是通過 Gaussian Mixture 類實(shí)現(xiàn)的,要優(yōu)化的主要配置是“ n _ clusters ”超參數(shù),用于指定數(shù)據(jù)中估計(jì)的群集數(shù)量。下面列出了完整的示例。

# 高斯混合模型 from numpy import unique from numpy import where from sklearn.datasets import make_classification from sklearn.mixture import GaussianMixture from matplotlib import pyplot # 定義數(shù)據(jù)集 X, _ = make_classification(n_samples=1000, n_features=2, n_informative=2, n_redundant=0, n_clusters_per_class=1, random_state=4) # 定義模型 model = GaussianMixture(n_components=2) # 模型擬合 model.fit(X) # 為每個(gè)示例分配一個(gè)集群 yhat = model.predict(X) # 檢索唯一群集 clusters = unique(yhat) # 為每個(gè)群集的樣本創(chuàng)建散點(diǎn)圖 for cluster in clusters: # 獲取此群集的示例的行索引 row_ix = where(yhat == cluster) # 創(chuàng)建這些樣本的散布 pyplot.scatter(X[row_ix, 0], X[row_ix, 1]) # 繪制散點(diǎn)圖 pyplot.show()運(yùn)行該示例符合訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上的模型,并預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)集中每個(gè)示例的群集。然后創(chuàng)建一個(gè)散點(diǎn)圖,并由其指定的群集著色。在這種情況下,我們可以看到群集被完美地識(shí)別。這并不奇怪,因?yàn)閿?shù)據(jù)集是作為 Gaussian 的混合生成的。

使用高斯混合聚類識(shí)別出具有聚類的數(shù)據(jù)集的散點(diǎn)圖

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