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洛斯阿拉莫斯實驗室聯(lián)手希捷,嘗試將計算與機械硬盤相結(jié)合

存儲界 ? 來源:存儲界 ? 2023-03-22 11:20 ? 次閱讀

用于模擬各類場景的高性能計算(HPC)類工作負載,總會產(chǎn)生大量有待篩選的數(shù)據(jù)。事實上,這也正是HPC與AI的最大區(qū)別:前者輸入數(shù)據(jù)少,輸出數(shù)據(jù)多;后者則需要輸入大量信息,通過訓練轉(zhuǎn)化為神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中的少量參數(shù)和權(quán)重。

但在HPC模擬所生成的數(shù)萬億個粒子當中,真正值得研究人員關(guān)注的可能只是幾百或幾千個粒子的實際行為。

洛斯阿拉莫斯國家實驗室副部門負責人加里·格里德(Gary Grider)在采訪中表示,“這就像是大海撈針,實際要尋找的只是總體數(shù)據(jù)中的小小一部分?!边@個問題在體量較小的數(shù)據(jù)集上相對好些,但阿拉莫斯實驗室卻向來以超大規(guī)模研究著稱。“我們可能會運行一個內(nèi)存占用量高達PB級別的實驗,而它往往每隔幾分鐘就輸出一次PB級數(shù)據(jù)”,且整個過程會持續(xù)半年之久。

為了篩選這些數(shù)據(jù),科學家們使用一套分析工具來查明到底哪些信息真正具有價值。過去幾年來,阿拉莫斯實驗室一直在想辦法讓分析負載跟數(shù)據(jù)盡可能接近,甚至考慮把計算轉(zhuǎn)移到閃存或硬盤控制器上。從某種意義上說,阿拉莫斯實驗室及其合作伙伴想要構(gòu)建一套大型磁盤控制器集群,利用上面的空閑時鐘周期來處理分析功能。

阿拉莫斯實驗室的研究人員已經(jīng)取得了一定進展。通過與SK海力士合作,他們實現(xiàn)了將規(guī)約功能引入控制器的概念驗證,借此獲得了幾個數(shù)量級的性能改進。

格里德表示,“我們已經(jīng)證明,通過對規(guī)約這類簡單分析的全速執(zhí)行,磁盤驅(qū)動器自身就能從磁盤內(nèi)提取數(shù)據(jù),從而徹底消除了傳輸帶寬產(chǎn)生的成本。”

跟能源部下轄的其他HPC實驗室一樣,阿拉莫斯實驗室同樣采用分層存儲架構(gòu),目前已經(jīng)開始在更大的磁盤池上做類似的探索。為了更進一步,阿拉莫斯實驗室與希捷簽訂了合作研發(fā)協(xié)議。

“事實證明,希捷方面也在嘗試將部分負載轉(zhuǎn)移到存儲設(shè)備上。他們已經(jīng)擁有原型方案,處理器就部署在磁盤驅(qū)動器旁邊?!?/p>

彈性問題

但大家都知道,機械硬盤與閃存不同。閃存內(nèi)部不存在移動部件,而且在使用壽命之內(nèi)具有相對更可預(yù)測的故障率。相比之下,硬盤驅(qū)動器內(nèi)部存在機械結(jié)構(gòu),隨時都有可能發(fā)生故障。這就要求對硬盤做一定程度的彈性化改造——換言之,引入擦除碼或RAID。

“但這也會增加分析流程的復(fù)雜度。要進行分析,我們必須了解數(shù)據(jù)是什么。但磁盤驅(qū)動器往往做不到它一點,它只會把所有信息都看作數(shù)據(jù)塊?!?/p>

因此加里德的團隊必須從零開始構(gòu)建一套專用于存儲加速分析的文件系統(tǒng),否則一切都只是空談。

“我們不希望這事只有阿拉莫斯實驗室自己參與,畢竟我們后續(xù)得定期采購、還需要廠商提供售后支持?!?/p>

于是,阿拉莫斯實驗室選擇對現(xiàn)有文件系統(tǒng)做“魔改”,選擇的則是Sun Microsystems早年間打造的Zettabyte文件系統(tǒng)。這是一套專門管理大型彈性磁盤驅(qū)動器池的系統(tǒng),如今被人們親切稱為Spinning Rust。ZFS還能配合Gluster實現(xiàn)多節(jié)點擴展,Gluster則是Red Hat當初收購來的集群文件系統(tǒng)。至于分析任務(wù),工程師們將努力調(diào)整文件系統(tǒng),讓它能與Apache的分析堆棧配合運作。

“我們希望努力打造出任何人都能使用的標準工具。”

雖然阿拉莫斯實驗室及其合作伙伴有望構(gòu)建起一套能夠直驅(qū)分析處理的文件系統(tǒng),但其初期部署難度絕不是一般用戶所能承受的。

因此,格里德希望進一步完善文件系統(tǒng)和分析工具,吸引標準機構(gòu)和軟件開發(fā)者為其添加更多功能,最終打造出一款面向主流受眾的新方案。

任重而道遠

格里德也承認,這方面還有很多工作要做。“要達到消費級應(yīng)用的程度,可謂是任重而道遠。我們接下來要做的是將其轉(zhuǎn)化成某種對象模型,而不再是文件中的一個個塊?!?/p>

目前,阿拉莫斯實驗室的初步目標是將少量分析功能轉(zhuǎn)移至磁盤控制器。

“我們還沒有將完整的分析工作負載轉(zhuǎn)移到磁盤驅(qū)動器上,目前做的主要是規(guī)約還有一部分合并。但總體來看,規(guī)約已經(jīng)可以在設(shè)備層次上實現(xiàn),之后還有合并和排序這類通常在閃存或內(nèi)存中實現(xiàn)的操作?!?/p>

目前最大的障礙并不是算力,而是磁盤所內(nèi)置的有限內(nèi)存。格里德坦言,“現(xiàn)在磁盤的內(nèi)置內(nèi)存太小,不足以做排序,只能完成選擇操作。所以接下來的問題是,我們要怎樣增加磁盤的內(nèi)置內(nèi)存容量來提升操作復(fù)雜度?!?/p>

審核編輯 :李倩

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原文標題:洛斯阿拉莫斯實驗室聯(lián)手希捷,嘗試將計算與機械硬盤相結(jié)合

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