抗生素耐藥性(Antibiotic resistance,AR)危機(jī)在全球范圍內(nèi)日益嚴(yán)重。抗生素耐藥性的增加很大程度上是由于在人類醫(yī)學(xué)、獸醫(yī)學(xué)以及畜牧業(yè)中對(duì)抗生素的過(guò)度使用而導(dǎo)致的。抗生素耐藥性由多種因素引起,包括過(guò)度使用抗生素、缺乏可確定抗生素敏感性的快速實(shí)驗(yàn)室測(cè)試,以及使用無(wú)效或效果較差的抗生素等。因此,推進(jìn)抗生素敏感性快速測(cè)試技術(shù)的開發(fā)和使用,以識(shí)別和表征耐藥細(xì)菌,從而有針對(duì)性地給藥是對(duì)抗抗生素耐藥性的關(guān)鍵。
據(jù)麥姆斯咨詢報(bào)道,近日,美國(guó)康奈爾大學(xué)(Cornell University)研究人員開發(fā)了一種具有梯度設(shè)計(jì)的微流控系統(tǒng),可產(chǎn)生與當(dāng)前國(guó)家和國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)相當(dāng)?shù)?倍連續(xù)稀釋的抗生素。研究人員的整合設(shè)計(jì),通過(guò)最少的處理步驟,將抗生素敏感性測(cè)試時(shí)間從16~20小時(shí)縮短至4~5?小時(shí)。研究人員的可行性測(cè)試結(jié)果與商用抗生素敏感性測(cè)試(AST)結(jié)果一致,從尿路感染(UTI)的犬類中分離的革蘭氏陰性和革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌的一致性顯示為91.75%,并且可在沒(méi)有預(yù)先分離或濃縮的情況下使用。該微流控平臺(tái)為抗生素敏感性測(cè)試提供了一種高效、適應(yīng)性強(qiáng)的診斷工具。
系統(tǒng)說(shuō)明
用于抗生素敏感性測(cè)試的梯度微流控系統(tǒng)結(jié)合了基于納升級(jí)微腔室的抗生素敏感性測(cè)試的方法與梯形濃度梯度發(fā)生器(LCGG)裝置。這種組合為快速實(shí)現(xiàn)抗生素敏感性測(cè)試提供了標(biāo)準(zhǔn)化和可調(diào)控的抗生素濃度分布。該平臺(tái)由與傳統(tǒng)載玻片結(jié)合的圖案化聚二甲基硅氧烷(PDMS)層組成,可使每個(gè)裝置測(cè)試一種抗生素/細(xì)菌組合。每個(gè)裝置提供10種2倍稀釋濃度,并在每種濃度的“一式三份”微腔室中進(jìn)行測(cè)試,其中包括陽(yáng)性生長(zhǎng)對(duì)照(無(wú)抗生素)微腔室。微腔室從梯形濃度梯度發(fā)生器的主要通道中分支出來(lái),用作生物反應(yīng)器,在抗生素中培養(yǎng)細(xì)菌。
圖1:梯度微流控系統(tǒng)設(shè)計(jì)及工作原理
裝置的設(shè)計(jì)和仿真
該裝置的一個(gè)關(guān)鍵工程挑戰(zhàn)是匹配稀釋劑(純培養(yǎng)基)與進(jìn)入的抗生素的流速,并在每個(gè)環(huán)路處產(chǎn)生2倍稀釋。在沒(méi)有任何控制功能的情況下,稀釋劑將僅能到達(dá)環(huán)路的一半,因?yàn)樽枇ψ钚〉穆窂绞歉浇某隹?,流體可以從此處流出系統(tǒng)。研究人員通過(guò)增加側(cè)通道上的液壓阻力來(lái)解決這個(gè)問(wèn)題,從而驅(qū)動(dòng)稀釋劑到達(dá)所有環(huán)路。在研究人員設(shè)計(jì)的梯度結(jié)構(gòu)中,所需濃度分布的阻力近似值可通過(guò)電路邏輯模型來(lái)計(jì)算。
研究人員使用計(jì)算流體動(dòng)力學(xué)(CFD)仿真來(lái)確定收縮的液壓阻力作為其長(zhǎng)度的函數(shù)(圖2b~2d)。計(jì)算流體動(dòng)力學(xué)模擬結(jié)果表明,?40?μm x 655?μm(寬度x長(zhǎng)度)的縮窄具有與混合器相同的液壓阻力(圖2d)。
圖2:計(jì)算流體動(dòng)力學(xué)模擬和壓力節(jié)點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)
操作原理
梯度微流控系統(tǒng)的操作遵循研究人員之前制定的方案。研究人員使用標(biāo)準(zhǔn)化陽(yáng)離子調(diào)節(jié)的Mueller-Hinton肉湯來(lái)制備所有溶液,?添加2%v/v PrestoBlue(細(xì)胞活力檢測(cè)試劑)作為細(xì)胞代謝指標(biāo)。該平臺(tái)的加載包括以下三個(gè)步驟:(1)使用注射器將細(xì)菌懸浮液加載到裝置中;(2)使用注射泵將培養(yǎng)基中的抗生素溶液和清潔培養(yǎng)基通過(guò)兩個(gè)不同的端口加載到裝置中,以在主通道網(wǎng)絡(luò)中產(chǎn)生濃度分布。這一步驟沖走了主通道中的細(xì)菌,但留下了那些在終端微室中的細(xì)菌??股馗鶕?jù)特定的藥物加載時(shí)間擴(kuò)散到微腔室中;(3)系統(tǒng)加載生物級(jí)礦物油以隔離微腔室。一旦微腔室被密封,芯片上的水浴池就裝滿了水,然后該裝置在37?°C下培養(yǎng)?4~5小時(shí)。
在細(xì)菌加載、抗生素加載和微腔室密封這三個(gè)步驟中,只有步驟2的加載時(shí)間隨所測(cè)試的抗生素的不同而變化。表征抗生素加載到微腔室和產(chǎn)生的濃度分布是最重要的,以確定該系統(tǒng)的操作程序。
圖3:梯度濃度的表征
對(duì)臨床分離株進(jìn)行抗生素敏感性測(cè)試
研究人員用來(lái)自犬尿路感染樣本中的細(xì)菌分離物檢測(cè)梯度微流控系統(tǒng)在確定最低抑菌濃度(MIC)時(shí)的性能特征,這些樣本被提交給康奈爾動(dòng)物健康診斷中心(AHDC)進(jìn)行抗生素敏感性測(cè)試(圖4a)。研究人員重點(diǎn)研究了2007~2017年間在該設(shè)施培養(yǎng)的犬尿路感染中最常見的四種傳染性微生物:大腸桿菌(EC)、奇異變形桿菌(PRM)、糞腸球菌(EF)和假中間葡萄球菌(SP)。研究人員總共檢測(cè)了30株細(xì)菌分離株。這四種細(xì)菌占所有病例的66.7%。
圖4:梯度微流控系統(tǒng)對(duì)臨床獸醫(yī)樣本中細(xì)菌分離物抗生素敏感性測(cè)試效果
綜上所述,研究人員設(shè)計(jì)、優(yōu)化并使用了一種進(jìn)行抗生素敏感性測(cè)試的梯度微流控系統(tǒng);包含標(biāo)準(zhǔn)化、易理解的測(cè)試參數(shù);然后測(cè)試從培養(yǎng)皿分離出的細(xì)菌或直接從尿液樣品分離的細(xì)菌。該系統(tǒng)利用階梯狀網(wǎng)絡(luò)生成連續(xù)2倍稀釋的濃度,遵循當(dāng)前的標(biāo)準(zhǔn)化方法和規(guī)定,并且可調(diào)節(jié)以適應(yīng)大量臨床相關(guān)的抗生素和抗生素組合。當(dāng)使用單一抗生素測(cè)試時(shí),包括細(xì)菌加載、抗生素加載和油加載在內(nèi)的總制備時(shí)間,最快可達(dá)10分鐘,而抗生素組合測(cè)試也不超過(guò)15分鐘。該梯度微控控系統(tǒng)的一個(gè)重點(diǎn)考慮因素是在微尺度和小空間內(nèi)對(duì)抗生素進(jìn)行2倍連續(xù)稀釋。該梯度微流控系統(tǒng)是迄今為止第一個(gè)使用電路邏輯在微流控中產(chǎn)生梯度濃度的系統(tǒng)。
醫(yī)療設(shè)備想要通過(guò)審批,需要與如敏化獸醫(yī)尿路感染臺(tái)(SVU)等金標(biāo)準(zhǔn)設(shè)備達(dá)成95%以上的一致性,因此,盡管梯度微流控芯片很有前景,但仍缺乏可接受性。未來(lái),梯度微流控系統(tǒng)應(yīng)采用自動(dòng)上料、樣品處理、實(shí)時(shí)圖像分析等技術(shù),以提高過(guò)程的準(zhǔn)確性。此外,還應(yīng)進(jìn)行進(jìn)一步的臨床研究,以擴(kuò)大抗生素敏感性測(cè)試平臺(tái)的使用范圍,直接從含有更多相關(guān)細(xì)菌/抗生素的樣本中提取并進(jìn)行測(cè)試,同時(shí)檢查尿路感染以外的其它疾病模型,以探索該梯度微流控系統(tǒng)在臨床診斷中的其它用途。
審核編輯:劉清
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原文標(biāo)題:用于抗生素敏感性快速測(cè)試的梯度微流控系統(tǒng)
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