齲病、牙周炎、種植體周圍炎等口腔疾病通常由多種口腔細(xì)菌共同作用引起,這對人們的生活質(zhì)量產(chǎn)生了嚴(yán)重的影響。長期的口腔細(xì)菌感染甚至?xí)?dǎo)致全身系統(tǒng)性疾病。因此,快速識(shí)別多種細(xì)菌并及時(shí)抗菌有利于早期控制感染并提高治愈率。
然而,傳統(tǒng)的細(xì)菌檢測方法如培養(yǎng)法、PCR、ELISA等技術(shù)均存在著操作復(fù)雜、耗時(shí)耗力、成本高等不足,且等待檢測結(jié)果通常需要數(shù)小時(shí)或數(shù)天,此時(shí)再利用抗菌手段進(jìn)行治療往往會(huì)錯(cuò)過治療的窗口期,導(dǎo)致治療延誤。而近些年基于“鎖-鑰”的檢測模式盡管具有高靈敏度與高特異性,但往往只能檢測某種特異性的目標(biāo)細(xì)菌,難以同時(shí)針對多種細(xì)菌進(jìn)行檢測,這使其在復(fù)雜的臨床應(yīng)用中受限。因而,開發(fā)一種同時(shí)檢測多種細(xì)菌且同時(shí)有效抗菌的一體化平臺(tái)對于口腔疾病的預(yù)防和診治具有重要意義。
近日,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院唐子圣教授團(tuán)隊(duì)與上海工程技術(shù)大學(xué)魯娜研究員團(tuán)隊(duì)提出并構(gòu)建了DNA編碼的納米酶傳感器陣列,實(shí)現(xiàn)了多種口腔細(xì)菌的準(zhǔn)確識(shí)別及同時(shí)有效抗菌的目標(biāo)。這種傳感器陣列以DNA編碼的四氧化三鐵納米顆粒(IONPs)為傳感元件,利用細(xì)菌對DNA編碼納米酶的差異相互作用,成功鑒定了11種口腔細(xì)菌和6種蛋白質(zhì),并且實(shí)現(xiàn)了細(xì)菌的定量測定,細(xì)菌混合物樣本、盲樣和人工唾液樣本的準(zhǔn)確區(qū)分。
更重要的是,該傳感器陣列可及時(shí)有效地殺死多種細(xì)菌。相關(guān)論文以“Enhanced “Electronic Tongue” for Dental Bacterial Discrimination and Elimination Based on a DNA-Encoded Nanozyme Sensor Array”為題發(fā)表在ACS Appl. Mater. Interfaces期刊上,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院博士研究生張靈、復(fù)旦大學(xué)附屬口腔醫(yī)院牙體牙髓科主治醫(yī)師漆正楠為文章的共同第一作者, 上海工程技術(shù)大學(xué)材料科學(xué)與工程學(xué)院的魯娜研究員與上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院口腔科的唐子圣教授為共同通訊作者。
受到哺乳動(dòng)物味覺系統(tǒng)的啟發(fā),研究人員提出了基于陣列的傳感策略(又稱為“電子舌”),其具有高通量的檢測效率。與傳統(tǒng) “一對一”的傳感模式不同,傳感陣列基于多種傳感元件與目標(biāo)分析物的非特異性交叉反應(yīng),傳感信號(hào)經(jīng)檢測量化后利用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法(如LDA等)來進(jìn)行相互識(shí)別(圖1A)。
圖1 (A)哺乳動(dòng)物味覺系統(tǒng)工作原理示意圖;(B)DNA/IONPs納米傳感陣列檢測多種細(xì)菌與抗菌示意圖
在該項(xiàng)研究中,研究人員利用3種非特異性DNA修飾四氧化三鐵納米酶作為傳感元件,構(gòu)建了比色型納米傳感器陣列(圖1B)。該傳感陣列利用傳感元件與多種目標(biāo)細(xì)菌樣本相互作用,催化無色底物TMB產(chǎn)生藍(lán)色產(chǎn)物獲得吸光度值矩陣,經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析后進(jìn)行識(shí)別區(qū)分。圖2的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該納米傳感器陣列可準(zhǔn)確識(shí)別變異鏈球菌、嗜酸乳桿菌等11種常見的具有不同尺寸、表面形態(tài)及電荷的口腔細(xì)菌。LDA圖(圖2B)可直觀地將同一種細(xì)菌聚集成一類,而11種細(xì)菌則被準(zhǔn)確地分為11個(gè)類別,相互之間無重疊,表明檢測的準(zhǔn)確率為100%。
圖2 納米傳感器陣列檢測11種口腔細(xì)菌:(A)柱狀圖;(B)LDA圖;(C)熱圖;(D)HCA圖
此外,為評價(jià)該納米傳感器陣列的臨床應(yīng)用潛能,研究人員將人工唾液細(xì)菌樣本和人牙菌斑樣本作為檢測目標(biāo)進(jìn)行識(shí)別分析。如圖3所示,11種代表性的人工唾液細(xì)菌樣本的95%置信橢圓彼此之間沒有重疊和交叉,被準(zhǔn)確地識(shí)別開來。
圖3 (A)納米傳感器陣列對人工唾液樣本的檢測;(B)柱狀圖;(C)LDA圖;(D)熱圖;(E)HCA圖
本研究在臨床中收集了6例齲病患者與3例健康人群的牙菌斑樣本,利用納米傳感器陣列進(jìn)行檢測。這些比人工唾液細(xì)菌樣本更為復(fù)雜的人牙菌斑樣本也可根據(jù)口腔健康狀態(tài)準(zhǔn)確地分為兩類(圖4),即左側(cè)為齲病患者樣本,右側(cè)為健康人群樣本。表明該納米傳感器陣列具有較好的臨床應(yīng)用前景。
圖4 納米傳感器陣列檢測人牙菌斑樣本LDA圖
本文進(jìn)一步研究了上述構(gòu)建的納米傳感器陣列在檢測細(xì)菌過程中的抗菌作用。如圖5所示,該納米傳感器陣列對所選取的3種代表性口腔細(xì)菌均有較好的抗菌作用,表明其為兼具檢測多種細(xì)菌以及抗菌為一體的多功能平臺(tái)。
圖5 (A)納米傳感器陣列抗菌示意圖;(B)CFU計(jì)數(shù)圖;(C)細(xì)菌平板計(jì)數(shù)圖;(D)SEM圖
綜上所述,該研究利用構(gòu)建的DNA編碼的納米傳感器陣列,可成功識(shí)別11種口腔細(xì)菌且能在細(xì)菌檢測的同時(shí)有效抗菌,并具有很好的臨床應(yīng)用前景。該納米傳感器陣列具有以下優(yōu)勢:首先,可同時(shí)實(shí)現(xiàn)多種細(xì)菌的檢測,提高了檢測效率;其次,DNA鏈的可編碼性和多樣性,可為傳感陣列提供無限數(shù)量的傳感元件;然后,在檢測細(xì)菌的同時(shí)還可早期快速殺菌。該傳感策略操作快速簡便,成本低,為細(xì)菌感染性疾病的早期診斷和治療提供了新的思路。
審核編輯:劉清
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原文標(biāo)題:基于DNA編碼納米酶傳感器陣列的電子舌,用于口腔細(xì)菌的識(shí)別與清除
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