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大規(guī)模申威眾核環(huán)境下二維數(shù)據(jù)的計算方法

2021-05-13 | rar | 1.92 MB | 次下載 | 免費

資料介紹

  隨著超級計算機及其編程環(huán)境的發(fā)展,異構系統(tǒng)結枃下的多級并行編程將成為趨勢,神威·太湖之光囯產(chǎn)超級計算機就是其中的一個典型。自2016年神威·太湖之光運行以來,國內(nèi)外很多學者在其上進行了方法研究和應用驗證,為申威環(huán)境積累了比較豐富的眾核仳編程方法及優(yōu)化方法。但是,將全球系統(tǒng)模弌CESM移植到申威眾核環(huán)境時,對于海洋分量模式POP中的一些二維數(shù)據(jù)計算,常用的眾核優(yōu)化方法在1024進程規(guī)模下運行時具有較好的加速效果,然而在16800大規(guī)模進程下運行時眾核化會失效,表現(xiàn)為負加速。針對上述問題,文中提出了一種基于從核分區(qū)的并行計算方法,一個核組內(nèi)的64個從核被分成多個互不交叉的從核分區(qū),將可以獨立計算的多個代碼段計算任務分別分配到不同的從核分區(qū)上進行運行,能夠有效利用從核的計算能力,還可以實現(xiàn)對多個獨立的代碼段進行計算時間隱藏。每個從核分區(qū)內(nèi)的從核數(shù)量及從核號可以根據(jù)擬分配的計算任務情況進行適當選取,使得毎個從核都能達到較適宜的數(shù)據(jù)量和計算量。在采用前述從核分區(qū)方法的基礎上,結合使用循環(huán)合并和函數(shù)上提等方法增大程序并行粒度,提高了二維數(shù)據(jù)計算在大規(guī)模進程下的可擴展性,CESM模式高分辨率G算例中POP分量模式在110萬核心規(guī)模下的模擬速度提高了0.8模式年/天,眾核化的加速效果明顯。

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