資料介紹
通過對HS3D 數(shù)據(jù)集供點序列堿基的統(tǒng)計分析,利用供體位點鄰域堿基出現(xiàn)規(guī)律構(gòu)造模式(motif)作為DNA 序列的屬性。設(shè)置序列屬性值將字符序列映射成數(shù)字向量,應(yīng)用支撐向量機進行實驗,實現(xiàn)對供體位點的預(yù)測分類。實驗結(jié)果表明,與改進的motif 得分模型方法相比,該文方法可有效去除數(shù)據(jù)中異常數(shù)據(jù)對分類的影響,將DNA 字符序列變換到motif 屬性數(shù)字序列空間具有有效性和實用性。
關(guān)鍵詞:序列模式;剪切位點;支撐向量機
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